Progenesis QI for Proteomics バージョン 3 MSe の解析がハングアップする - WKB55784

症状

• MSe、HD-MSe、または SONAR データ解析がハングアップする Progenesis QI for Proteomics バージョン 3
• コンピューターのすべての RAM が使用されているため、コンピューターの応答が遅く、応答しない
• Windows の［Task Manager］（タスクマネージャー）を開き、［Process］（プロセス）タブに移動し、RAM の使用状況で並べ替えると、peptide3D.exe というプロセスにより使用可能な RAM がほとんどすべて使用されています。

環境

• Progenesis QI for Proteomics バージョン 3

注 - これはバージョン 3 に固有であり、バージョン 4 以降で修正されています

原因

MSe 解析中に peptide3D.exe で使用される既定の低エネルギーから高エネルギーまでのピーク一致設定は、特に正しく最適化されていないために Apex3D しきい値が低すぎる場合に、peptide3D に多くの RAM が必要であることを意味します。その結果、64 GB の RAM を搭載した PC であっても、一部のデータセットで苦労することがあります。これらの設定は Progenesis QI for Proteomics 内から設定できませんが、コマンドファイルを使用して変更できます。

解決策

1. 添付ファイル peptide3D_params.txt を C:\Program Files (x86)\Nonlinear Dynamics\Progenesis QI for proteomics\Plugins\WatersRawFolderReader\Processing\ を保存します
2. 解析中のデータの Apex3D しきい値を最適化して（WKB1232 を参照）、データを再解析します。

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