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ペプチドマッピングデータの解析にすべてのメモリが使用される - WKB108869

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症状

  • 多数のジスルフィド結合とミスクリーベージを含むペプチドマッピングにより、多くのフラグメントイオンが生成され、メモリエラーが発生することがあります

環境

  • UNIFI 1.9.4
  • UNIFI 1.9.9

原因

  • CRI-138 (INFULA-1201)

解決策

ジスルフィド結合がある場合とない場合の質量分析検索を実行して、タンパク質の潜在的なジスルフィド結合領域のマップを作成します。
次に、1 つまたは 2 つのジスルフィドをタンパク質に追加し、
徐々にペプチドマッピングに情報を追加します。

ペプチド当たりのジスルフィドが 2 つ以上の複雑なジスルフィドパターンの場合は、配列からペプチド鎖を削除することを検討してから、その鎖のカスタム Cys 修飾を作成します。前側からの配列および/または後ろ側からの配列を使用して、その鎖を特定の Cys 残基に対応。

 

追加情報

 

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