UNIFI での手動成分割り当てはどのように機能しますか? - WKB13608
環境
- waters_connect(全バージョン)での UNIFI アプリ
- UNIFI 1.9.4
- UNIFI 1.8.2
回答
成分を手動で割り当てるオプションは、対象ピークの「代替の割り当て」の決定によって異なります。
[代替の割り当て]フィールドは、同定アルゴリズムの実行後にソフトウェアによって自動的に表示されます。
「はい」は、所定の m/z 値があるピークに対して、可能なマッチとして、ソフトウェアは 1 つ以上の修飾されたタンパク質を同定したことを意味します(可能なマッチ数は、分析メソッドで設定された質量許容範囲の影響を受けます。より大きな質量許容範囲を設定する場合は、可能なマッチをより多く得ることができます)。
可能なマッチが複数見つかった場合、「最適なマッチ」アルゴリズムは最適なマッチを決定し、これがピーク質量に割り当てられる成分となり、他の可能なマッチが代替となります。
[代替の割り当て]が[はい]に設定されている成分があり、[手動割り当ての実行]ボタン(画面の左側にある成分テーブルと成分サマリーテーブルの両方にある)を押した場合、表示されるダイアログ画面には、ソフトウェアによって検出されたすべての代替が表示されます。ユーザーは、手動割り当てが必要かどうかを決定できます。
- ソフトウェアによって同定された最適なマッチを別の代替に置き換えます。
- 成分の詳細を編集します。
- [削除] - このオプションは、最適なマッチの割り当てを実際に削除し、ピーク質量を候補に変更します。
「いいえ」は、ソフトウェアでピークの可能なマッチが 1 つだけ見つかったことを意味します。
[代替の割り当て]が[いいえ]に設定されている成分がある場合、[手動割り当ての実行]ボタンを押すと、以下のいずれかを実行できます。
- 成分の詳細を編集します。
- 削除 - このオプションは、最適なマッチの割り当てを実際に削除し、ピーク質量を候補に変更します。
説明している 2 つの手動割り当ての違い:
成分テーブルのツールバーからの[手動割り当ての実行]により、ピーク質量の成分割り当てが変更されます(所定の m/z に割り当てられる代替が考察されます)。
注:成分サマリーテーブルのツールバーからの[代替の割り当てを表示]は同じように機能しますが、一貫性がありません。3.gif を参照してください。
クロマトグラムのコンテキストメニューの[ツール]オプションからの[手動割り当て成分]は、所定の保持時間に割り当てられる成分を変更するためのオプションです。
例えば、以下のシナリオを想定しましょう。
RT 1 分にピークがある TIC クロマトグラムと、RT 1.1 にピークがある TUV クロマトグラムがあります(オフセットの設定が適切にセットアップされています)。
TIC ピークの下には 2 つの質量ピークがあります:m/z 1(レスポンス 1000、実測 RT 1 分)、m/z 2(レスポンス 500、実測 RT 1 分)
2 つの質量ピークの同定を実行すると、ソフトウェアによって以下が決定されます。
- m/z 1:最適なマッチが成分 A 、可能な代替が B および C
- m/z 2:最適なマッチが成分 D、可能な代替はない
m/z 1 のレスポンスが高く、成分 A が最も一致しているため、TIC ピークは A に関連するものとして注釈が付けられます。次に、成分 A も TUV ピークに割り当てられるように設定されます(RT 設定によるターゲットに基づいて)。
成分テーブルのツールバーから[手動割り当ての実行]を実行し、成分 A を成分 B に置き換えると、TIC ピークの注釈がそれを反映するように変更されます。TUV ピークの注釈が削除され、[ツール]から[手動割り当て成分]を選択すると、成分 B をピークの割り当てとして選択できます。
手動割り当てウィザードのすべてのオプションは、[成分]テーブルからのみ使用できます。レビュー画面の左上にあるワークフローアイコンをクリックして、[注入および成分]を選択することで、このテーブルにアクセスできます。クロマトグラムを右クリックしてウィザードにアクセスすることもできますが、これによりオプションが少なくなり、サンプル全体には反映されません。
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