UNIFI のサイエンスライブラリーで、カスタムアミノ酸を作成する方法 - WKB191444

目的または目標

UNIFI のサイエンスライブラリーでカスタムアミノ酸を作成する。

環境

• UNIFI
• waters_connect

手順

1. KCS 記事「UNIFI のカスタムライブラリーで項目を作成する方法 - WKB26968」に従って、新しいライブラリー項目を作成します。必要に応じて新しいカスタムライブラリーを作成します
2. Web ブラウザーで、https://www.chemspider.com/ に移動し、ライブラリーに追加するカットメアミノ酸を検索します
3. カスタムアミノ酸が Chemspider データベースにある場合は、検索結果から .mol ファイルをダウンロードします。
4. 以下のステップを実行します。

waters_connect

1. waters_connect Hub で、Administration アプリを開き、Manage Libraries（ライブラリーの管理）を選択します。
2. ［Administration］（管理） > ［Scientific Library］（サイエンスライブラリー） > ［Manage Library Items］（ライブラリー項目の管理）で、［Create Library Items］（ライブラリー項目の作成）を選択します。
3. ［Item Name］（項目名）フィールドにカスタムアミノ酸の名前を入力し、［Library］（ライブラリー）ドロップダウンからそれを追加するカスタムライブラリーを選択します。
4. カスタムアミノ酸の .mol ファイルがある場合、
   1. ライブラリー項目エディターで［ツール］をクリックし、ドロップダウンメニューから構造式の読み込みを選択します 
   2. ステップ 1 でダウンロードした .mol ファイルを参照し、選択します。［Hill 計算式］、［平均モル質量］、［モノアイソトピック質量］、および［分子構造］の各フィールドは自動的に入力されます。
5. カスタムアミノ酸の .mol ファイルがない場合は、該当するフィールドに化学式を入力します
6. ［項目の種類］フィールドで［値］をクリックし、結果のドロップダウンメニューからアミノ酸を選択します。
7. ［プロパティ］ > ［同義語］で、同義語の種類ボックスをクリックします

7. 結果として表示されるメニューから、［3 Letter Code］（3 文字のコード）を選択します

8. ［同義語］フィールドに修飾アミノ酸の 3 文字のコードを入力し、Enter キーを押します。
9. 2 番目の［同義語］行で、ステップ 7 と 8 を繰り返しますが、今回は［1 文字コード］オプションを選択します
10. ［同義語］フィールドに、標準のアミノ酸に使用する文字以外の単一の文字を入力します。
    1. G、A、V、L、I、T、S、M、C、P、F、Y、W、H、K、R、D、E、N、Q 以外の文字は使用できます。
    2. 数字やほとんどの句読記号を含む任意の ASCII 文字を使用できます。中国語文字をテストしていない
    3. この例では、ポンド（ポンド記号）を使用しました
11. 項目名を入力します。単一のアミノ酸コードとして「ポンドスターリング」記号以外のものを選択した可能性がありますが、このようなものを入手できます。save（保存）ボタンを押して保存します

UNIFI 1.9.4

1. ドロップダウンメニューから、アミノ酸項目の種類を選択します。
2. カスタムアミノ酸の化学式を入力するか、.mol ファイルをインポートして構造式および化学式のフィールドに自動的に入力する。
3. ［同義語］セクションに、カスタムアミノ酸の 3 文字と 1 文字のコードを入力します 

追加情報

• アミノ酸の構造式を追加するには、KCS 記事「UNIFI のサイエンスライブラリーで低分子の構造式を追加する方法 - WKB191442」に従ってください。
• 水素原子は、［ツール］ > ［明白な水素を削除］をクリックして、構造式から非表示にできます。
• この記事は UNIFI サイエンスライブラリーに関する一連の記事の一部であり（UNIFI でサイエンスライブラリーを構築および管理する方法 - WKB190999）、次のリンクにあります：高度な UNIFI：サイエンスライブラリーの構築と管理 (715007127)。