UNIFI インタクトプロテインワークフローと INTACT Mass アプリケーションの解析結果が異なる - WKB271690

症状

• UNIFI アプリと INTACT Mass アプリのインタクトプロテインワークフローで、同じ波形解析パラメーターを使用して同じデータを分析すると、その 2 つで異なる波形解析結果が得られることがある

環境

• waters_connect
• INTACT Mass、タンパク質分析
• UNIFI、インタクトプロテインワークフロー

原因

UNIFI 解析メソッドで［バックグラウンド減算］が有効になっていません。

バックグラウンド減算は、INTACT Mass アプリでデフォルトで有効になっているため、INTACT Mass および UNIFI インタクトタンパク質ワークフローで同じデータを分析する場合と実際に比較するには、UNIFI 分析メソッドでバックグラウンド減算を有効にする必要があります。

INTACT Mass のピーク高さおよびピーク面積の結果と UNIFI インタクトプロテインでの同等の結果の間の差の大部分は、UNIFI インタクトプロテインメソッドでバックグラウンド減算が有効になっているかどうかに起因する可能性があります。バックグラウンド減算が有効になっていない場合、INTACT Mass と UNIFI で同じデータを同じパラメーターで解析すると、非常に異なる結果が得られます。しかし、自動パラメーターでバックグラウンド減算を有効にすると、INTACT Mass で見られた結果とほぼ同じ結果が得られました。

解決策

1. UNIFI 分析メソッドでバックグラウンド減算を使用するにし、バックグラウンド減算オプションの［自動］ボタンを選択します。

バックグラウンド減算が有効な結果。

追加情報

INTACT Mass および UNIFI は同じピーク検出アルゴリズムを使用します。ただし、UNIFI と waters_connect アプリケーションのアルゴリズムのソースコードは異なっており、相違が生じた可能性があり、それが結果に影響することがあります。そのため、UNIFI 解析メソッドで［バックグラウンド減算］を有効にしても、結果に小さな違いがあることがあります。