MassLynx 解析用 SCN（デスクトップ版）と 測定用 SCN では、バックグラウンドノイズ除去後のスペクトルが異なる - WKB4650

症状

• Combine Spectrum（Combine Scan とも呼ばれる）にて、バックグラウンドノイズを除去したスペクトルを表示させると、解析用 SCN（MassLynx デスクトップ版) では、多価イオンのピークが検出されない
• QTof 測定用 SCN では、Combine Spectrum で処理後も多価イオンのピークが検出される

環境

• MassLynx 4.1
  • MassLynx コントロール下の Xevo QTof 質量分析計（例えば、Xevo QTof、Xevo G2 QTof、Xevo G2-S QTof、Xevo G2-XS QTof）のデータ
  • Synapt 質量分析計（例えば、Synapt、Synapt G2、Synapt G2-S、Synapt G2-Si）のデータ
  • デスクトップ版　解析用 SCN（例えば、SCN 909、SCN 901、SCN 943）

原因

MassLynx 解析用 SCN に設定されているピーク分離パラメーターの初期値が、QTof  データに対して適切でない。

解決策

1. MassLynx の解析用 SCN（デスクトップ版)の Combine Spectrum 画面で、Peak separation パラメーターを 0.05 に変更します。

追加情報

これは、MassLynx の解析バージョン（デスクトップ版）が、四重極 MS 測定用 SCN を元に作成されているために、発生します。
このため、この解析設定およびその他の解析設定が、四重極 MS に適切な初期値に設定されており、QTof データには適していないことがあります。