Waters 標準試料 186008927、186009125、186009126 のアミノ酸配列は何ですか？ - WKB96794

環境

• 以下の 3 つの Waters 標準試料は同じ mAb タンパク質から製造されています。NIST mAb（ヒト化 IgG1_k）モノクローナル抗体は、マウス浮遊培養で発現される組換え抗体です。

  • ヒト化 mAb 質量確認標準試料 [186009125]

    • このサンプルは、16 のジスルフィド結合で連結した 2 本の軽鎖 (LC) と 2 本の重鎖 (HC) によるインタクト mAb で構成されています。修飾なしの平均モル質量は 145179.8052 g/mol であるはずです。

  • mAb サブユニット標準試料 [186008927]

    • このサンプルは、（Ides で還元、消化された）ヒト化 mAb 質量確認標準試料 [186009125] で構成されています。Ides 酵素は、グリシンとグリシンアミノ酸残基間の重鎖を切断します。このサンプルは、次の 3 つの配列で構成されています：Fc/2、Fd'、LC。

  • mAb トリプシン消化標準試料 [186009126]

    • このサンプルは、ヒト化 mAb 質量確認標準試料 [186009125] で構成されています。標準試料は、還元およびアルキル化されて、ジスルフィド結合が切断されてから、トリプシンで消化されます。このサンプルは、HC と LC の 2 つの配列で構成されています。

回答

mAb サブユニット Fc/2 配列（平均モル質量：23790.6425）

GPSVFLFPPK  PKDTLMISRT  PEVTCVVVDV  SHEDPEVKFN  WYVDGVEVHN  AKTKPREEQY  NSTYRVVSVL  TVLHQDWLNG
KEYKCKVSNK  ALPAPIEKTI  SKAKGQPREP  QVYTLPPSRE  EMTKNQVSLT  CLVKGFYPSD  IAVEWESNGQ  PENNYKTTPP
VLDSDGSFFL  YSKLTVDKSR  WQQGNVFSCS  VMHEALHNHY  TQKSLSLSPGK

mAb サブユニット Fd' 配列（平均モル質量：25705.8931）

QVTLRESGPA  LVKPTQTLTL  TCTFSGFSLS  TAGMSVGWIR  QPPGKALEWL  ADIWWDDKKH  YNPSLKDRLT  ISKDTSKNQV  VLKVTNMDPA
DTATYYCARD  MIFNFYFDVW  GQGTTVTVSS  ASTKGPSVFP  LAPSSKSTSG  GTAALGCLVK  DYFPEPVTVS  WNSGALTSGV  HTFPAVLQSS
GLYSLSSVVT  VPSSSLGTQT  YICNVNHKPS  NTKVDKRVEP  KSCDKTHTCP  PCPAPELLG

mAb LC（平均分子量：23127.5093）

DIQMTQSPST  LSASVGDRVT  ITCSASSRVG  YMHWYQQKPG  KAPKLLIYDT  SKLASGVPSR  FSGSGSGTEF  TLTISSLQPD  DFATYYCFQG
SGYPFTFGGG  TKVEIKRTVA  APSVFIFPPS  DEQLKSGTAS  VVCLLNNFYP  REAKVQWKVD  NALQSGNSQE  SVTEQDSKDS  TYSLSSTLTL
SKADYEKHKV  YACEVTHQGL  SSPVTKSFNR  GEC

mAb HC（平均モル質量：49478.5203）

QVTLRESGPA  LVKPTQTLTL  TCTFSGFSLS  TAGMSVGWIR  QPPGKALEWL  ADIWWDDKKH  YNPSLKDRLT  ISKDTSKNQV  VLKVTNMDPA
DTATYYCARD  MIFNFYFDVW  GQGTTVTVSS  ASTKGPSVFP  LAPSSKSTSG  GTAALGCLVK  DYFPEPVTVS  WNSGALTSGV  HTFPAVLQSS
GLYSLSSVVT  VPSSSLGTQT  YICNVNHKPS  NTKVDKRVEP  KSCDKTHTCP  PCPAPELLGG  PSVFLFPPKP  KDTLMISRTP  EVTCVVVDVS
HEDPEVKFNW  YVDGVEVHNA  KTKPREEQYN  STYRVVSVLT  VLHQDWLNGK  EYKCKVSNKA  LPAPIEKTIS  KAKGQPREPQ  VYTLPPSREE
MTKNQVSLTC  LVKGFYPSDI  AVEWESNGQP  ENNYKTTPPV  LDSDGSFFLY  SKLTVDKSRW  QQGNVFSCSV  MHEALHNHYT  QKSLSLSPGK

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