NVIDIA Quadro GPU を使用するように ProteinLynx Global Server 3.0.3 を設定する方法 - WKB52140

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目的または目標

ProteinLynx Global Server (PLGS) 3.0.3 で、Compute Unified Device Architecture (CUDA) 対応の NVIDIA Quadro シリーズグラフィックスプロセッサーユニット (GPU) を使用できるようにして、MSe、HD-MSe および SONARデータ解析を高速化します。

環境

PLGS3.0.3
Windows 7
Windows 10
Lenovo P720 ベースの PLGS 処理 PC
Lenovo P720 ベースの NLD ステージ 2 LM 解析 PC（Progenesis QI for Proteomics 用）
Lenovo P520 ベースの NLD ステージ 1 LM 解析 PC（Progenesis QI for Proteomics 用）

手順

Windows での検索で、「デバイスマネージャー」と入力します
［デバイスマネージャ］を開き、デバイスの種類のリストから［ディスプレイアダプター］を選択します
取り付けられている GPU を確認し、取り付けられている GPU をメモします
1. Lenovo P720 ベースの PLGS 処理 PC または P520 ベースの NLD Stage 1 Large Mol PC では、GPU の 1 つは NVIDIA Quadro P5000 または NVIDIA Quadro RTX 5000 である必要があります。
PLGS3.0.3 を閉じる
C:\PLGS3.0.3\lib\apex3d\ を開きます
そのフォルダーに既存の Apex3D64_params.txt ファイルがあるかどうかを確認します
1. コマンドファイルが存在しない場合
  1. 新しいテキストファイルを開きます。
  2. ステップ 3 で Quadro P5000 が見つかった場合は、「-preferredGPU P5000」と入力します。
  3. ステップ 3 で Quadro RTX 5000 が見つかった場合は、「-preferredGPU RTX 5000」と入力します。
  4. コマンドファイルを C:\PLGS3.0.3\lib\apex3d\Apex3d64_params.txt として保存します

注上記のコマンドは、上記に示されているとおりに入力する必要があります

既存の Apex3D64_params.txt がある場合、
1. メモ帳などのテキストエディターでそのファイルを開きます。
2. 既存の '-preferredGPU' コマンドを削除します
3. 他のコマンドの下に、お使いの GPU に関連するコマンドを入力します
4. コマンドファイルを保存します

PLGS3.0.3 を再起動します

追加情報

PLGS は当初、MSe 処理に NVIDIA Tesla シリーズ GPU のみを使用するように開発されました。 NVIDIA は、Tesla シリーズのカードを「サーバー専用」の製品として販売する機会を増やしています。ワークステーション PC は専用のオンボード GPU 冷却ファンがないため、過熱する傾向があるため、サーバー GPU は使用できません。ただし、現在では、ほとんどの NVIDIA GPU で CUDA が有効になっています。結果として、他の NVIDIA GPU に十分なオンボード専用 GPU RAM（12 GB を推奨）がある限り、理論的には PLGS を他の NVIDIA GPU を使用するように設定できます。ただし、この記事で説明されているように、コマンドファイルを使用して、Tesla 以外の GPU の使用が許可されていることを、PLGS に具体的に伝える必要があります。

この記事で説明されているコマンドは、PLGS3.0.3 に固有です。 PLGS 3.0.2 以前では機能しません

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