EZinfo の多変量解析における、ロード中のプロットに対する個々の LCMS ピークの寄与率はいくらですか - WKB53889

環境

• EZinfo
• Progenesis QI
• Progenesis QI for Proteomics
• UNIFI
• MarkerLynx

回答

個々の LC または MS データピークは、スコアプロットに間接的にのみ寄与します。スコアプロットは、さまざまなサンプルグループの間で最も異なる変数を示します。［Plots and Spreadsheets］（プロットとスプレッドシート）タブの［Scores］（スコア）ボタンにカーソルを合わせると、この説明が表示されます。

「Scores t[1] and t[2] are the most important indices in summarizing the dataset. The plot gives a picture of the data. The points in the plot are the observations in the data. Observations near each other in the plot are probably similar and observations far away from each other are dissimilar. The plot shows the presence of atypical observations, groups similarities, trends, and other patterns in the data.」（スコア t[1] および t[2] は、データセットを要約する上で最も重要な指標です。プロットはデータの概要を示しています。プロット内の点は、データ内の観測値です。プロット内のお互いに近い観測値は同様の可能性があり、互いに遠く離れた観測値は相違しています。プロットは、データ中の不規則な観測値、グループ類似性、傾向および他のパターンの存在を示します。）

スコアプロット「Show model statistics」（モデル統計の表示）では、t[1]（x 軸）および t[2]（y 軸）は、データとデータの平均の差の多次元散布図で描かれた最も近似している直線です。これらの線は、サンプルセット内の異なるグループのデータ間の最大差を表しています。R2X[1] および R2X[2] は、これらの直線の R の二乗値です。つまり、これらの直線がデータの多次元プロットにどれだけ近似するかを示す統計的尺度です（これを R²X[1] と書くとより明確になります）。

これは、「control」（コントロール）グループのサンプルよりも「treatment 1」（処理 1）グループのサンプルの方で、特定の保持時間にはるかに強いのピークが見られる場合、これらのピークは、「treatment 1」（処理 1）と「control」（コントロール）の相違に大きく寄与していることを意味します。
ホテリングの T2 値は、スコアプロットの 95% の信頼限界を表します。その楕円の外側にあるものはすべて、強い外れ値です。

近似度プロットは、スコアプロットによって表されるデータのモデルが実際にデータにどの程度近似しているかを図示したものです。

詳細な説明については、https://umetrics.com/sites/default/f..._parti-3_0.pdf 参照してください。

追加情報

注：MarkerLynx は製造中止となっており、Waters では、MarkerLynx も関連の EZinfo 2.0 も販売しなくなりました。ただし、上記の答えは EZinfo 2 または 3 にも同様に適用できます。