UNIFI で SYNAPT G2-Si MSMS データに成分が見つからない - WKB28317

症状

• UNIFI で MSMS データに成分が見つからないが、［インベスティゲイト］タブに親質量ピークは明らかに存在する

環境

• UNIFI 1.8.2
• UNIFI 1.9.4
• SYNAPT G2-Si
• SYNAPT G2
• SYNAPT
• Q-Tof Premier
• MassLynx 4.1
• MassLynx 4.2

原因

これは、Q-Tof 装置で生成された MassLynx MSMS データの問題です（記事 28313 を参照）。MassLynx がデータのスキャンを保存するとき、波形解析されたスペクトルピークのピーク質量を記録するのではなく、要求された設定質量が最初に electronics に規定され、データを記録します。MassLynx がデータのスキャンを再度読み取ると、指定された設定質量に TOF キャリブレーションが誤って適用されてから、スキャン統計内のディスクに書き込まれ、生ファイル内に保存されます。データを UNIFI にインポートすると、MassLynx データの正しくないピーク質量が親イオンの実測 m/z として使用されます。これは多くの場合、UNIFI 解析メソッドの予想質量と大きく異なるため、UNIFI メソッドの［質量によるターゲット］セクションで指定された質量許容値の範囲外になります。そのため、UNIFI では実測質量を予想質量に一致させることができません。

解決策

UNIFI 1.9.4 以前：唯一の既知の回避策は、UNIFI 解析メソッドの質量許容値を増加することです。40 ppm に増やす必要がある場合があります。ただし、これにより、同定が誤検出される可能性があることに注意してください。

この問題は、UNIFI 1.9.13（およびそれ以降のバージョン）を搭載した waters_connect では発生しません。MassLynx MSMS データが UNIFI 1.9.13 を搭載した waters_connect にインポートされるとき、ソフトウェアは MassLynx スペクトルヘッダーファイルから設定質量を読み取りません。代わりに、スペクトルデータから設定質量を計算します。これにより、正しい設定質量値が得られます。また、より厳密な質量許容値を解析メソッドで使用することができます。

追加情報

この同じ問題は、影響を受ける装置/MassLynx のバージョンから UNIFI にインポートされた DDA データ（Xevo G2-XS で取り込まれた MassLynx MSMS または DDA データを含む）に影響する可能性があります。